2009年2月27日 星期五
2009年2月26日 星期四
中山/成大聯合生物競試於5/23舉行
所有修普生的同學(含重修生)皆要參加此競試, 題目由中山與成大老師分別命題. 並採計為一次的測驗成績. 有關競試的具體細節與時程將在兩系確認後公告. 並可參考本課程blog先前有關"競試"的過往公告. 以下為參加生物競試成績達以下標準者本學期普生成績的加分標準:
- 達1%者: 加總分10分
- 達3%者: 加總分7分
- 達5%者: 加總分5分
- 達10%者: 加總分3分
- 達20%者: 加總分2分
2009年2月25日 星期三
什麼叫做有條有理的表達
從高中生變成大學生是要付出代價的. 各位的表達能力欠佳, 除了可能是由於MSN打太多之外, 對於寫作的鑑賞與練習太少也是主因. 如果各位是老師, 又如何希望一次看到50份語焉不詳的考卷呢? 一個"完整的答案"至少包含以下幾個元素:
- 議題背景的簡要陳述
- 對該議題解答/解讀的比較與確認的過程
- 經分析與歸納所獲致的結論
目前在各位的第一次測驗中完全看不到這樣的邏輯結構. 因為各位過去的學習經驗都是"寫到這幾個字就算對", 或者是因為考試幾乎都是填充, 選擇, 畫答案卡, 因此完全缺乏有條有理的表達能力. 希望我們在接下來的測驗, 作業與報告中能夠看到一點點的進步.
第一次作業的題目 (2009/03/04)
- Describe the contributions to evolutionary theory made by Linnaeus, Cuvier, Lyell, Lamarck, Malthus, and Wallace (25)
- Describe Lamarck’s theories, and explain why they have been rejected (15)
- Explain what Darwin meant by “descent with modification” (10)
- List and explain Darwin’s four observations and two inferences (20)
- Explain why an individual organism cannot evolve (15)
- Describe at least four lines of evidence for evolution by natural selection (15)
3/4當天請於8:30am準時抵達教室. 遲到10分鐘者不得進入教室. 以上為題目, 括號內則為其配分. 老師只抽問一人, 一人答錯, 則全班該題分數為0分. 請準備有條有理的說明, 並不得拿著資料照著唸. 請自行參考課本內容, 並搜尋資料協助理解. 若有不明瞭的地方, 請與老師討論.
2009年2月24日 星期二
本學期的上課時程
本學期的上課時程如下 (編號為週次)
- 02/18: 課程說明
- 02/25: Mechanisms of Evolution - Descent with modification: A Darwinian View of Life, 第一次測驗
- 03/04: The Evolution of Population 第一次作業
- 03/11: The Origin of Species & The History of Life on Earth
- 03/18: Phylogeny and the Tree of Life 第二次測驗
- 03/25: 校運會停課 第一次報告繳交 (演化電玩)
- 04/01: Bacteria, Archaea and Protists
- 04/08: Plant Diversity 第三次測驗
- 04/15: 期中考週
- 04/22: Fungi 第二次報告繳交 (科普讀物)
- 04/29: Animal Diversity - Invertebrates
- 05/06: Animal Diversity - Vertebrates
- 05/13: Ecology: Behavioral ecology 第四次測驗
- 05/20: 老師出國開會 第三次報告繳交 (生物飼養)
- 05/23: 中山與成大聯合生物競試 (所有修課同學皆要參加) (當作一次測驗成績)
- 05/27: Population & Community Ecology
- 06/03: Ecosystems & Conservation Biology
- 06/10: Summary 第四次報告繳交 (環境事件)
- 06/17: 期末考週
2009年2月22日 星期日
2009-02-25的首次小考
注意事項如下:
- 將於8:30 AM準時開始, 也就是說8:20就要入座才可準時發考卷. 8:40以後不可進入教室 (不接受任何理由, 什麼早上起不來或宿舍到理學院塞車之類的)
- 考試時間共計30分鐘
- 題型皆為選擇題(單選複選自行判斷)
- 考完之後立刻改考卷
所有同學的自訂分項成績比例
感謝女班代的匯整. 未提供比例的同學視同放棄這個權利, 由老師自行訂定.
學號 小考 作業 報告 師生討論
B942010003 30 30 20 10
B952010009 25 25 25 25
B952010012 25 25 25 25
B952010017 25 15 35 25
B952010047 20 40 30 10
B952010053 10 40 10 40
B953040026 30 20 30 20
B955020049 20 40 30 10
B962010007 - - - -
B962010028 30 35 25 10
B962010038 - - - -
B972010001 20 30 30 20
B972010002 20 15 30 35
B972010003 30 30 25 15
B972010005 25 40 25 10
B972010006 20 30 30 20
B972010007 30 20 35 15
B972010008 30 30 30 10
B972010009 25 25 25 25
B972010010 30 30 30 10
B972010012 30 25 20 25
B972010013 25 35 30 10
B972010014 10 40 30 20
B972010015 40 30 20 10
B972010016 30 30 30 10
B972010017 25 35 30 10
B972010018 10 20 40 30
B972010019 - - - -
B972010020 25 25 25 25
B972010021 15 35 30 20
B972010022 30 30 10 30
B972010023 35 30 15 20
B972010024 25 25 25 25
B972010025 30 30 30 10
B972010026 35 35 15 15
B972010027 30 30 30 10
B972010028 25 35 30 10
B972010029 30 30 30 10
B972010030 25 25 25 25
B972010031 30 30 20 20
B972010033 25 30 35 10
B972010035 20 30 30 20
B972010036 25 25 25 25
B972010037 20 35 25 20
B972010038 15 35 35 15
B972010039 30 30 20 20
B972010040 20 30 20 30
B972010042 20 30 30 20
B972010043 - - - -
B972010044 35 25 25 15
B972010045 30 30 20 20
學號 小考 作業 報告 師生討論
B942010003 30 30 20 10
B952010009 25 25 25 25
B952010012 25 25 25 25
B952010017 25 15 35 25
B952010047 20 40 30 10
B952010053 10 40 10 40
B953040026 30 20 30 20
B955020049 20 40 30 10
B962010007 - - - -
B962010028 30 35 25 10
B962010038 - - - -
B972010001 20 30 30 20
B972010002 20 15 30 35
B972010003 30 30 25 15
B972010005 25 40 25 10
B972010006 20 30 30 20
B972010007 30 20 35 15
B972010008 30 30 30 10
B972010009 25 25 25 25
B972010010 30 30 30 10
B972010012 30 25 20 25
B972010013 25 35 30 10
B972010014 10 40 30 20
B972010015 40 30 20 10
B972010016 30 30 30 10
B972010017 25 35 30 10
B972010018 10 20 40 30
B972010019 - - - -
B972010020 25 25 25 25
B972010021 15 35 30 20
B972010022 30 30 10 30
B972010023 35 30 15 20
B972010024 25 25 25 25
B972010025 30 30 30 10
B972010026 35 35 15 15
B972010027 30 30 30 10
B972010028 25 35 30 10
B972010029 30 30 30 10
B972010030 25 25 25 25
B972010031 30 30 20 20
B972010033 25 30 35 10
B972010035 20 30 30 20
B972010036 25 25 25 25
B972010037 20 35 25 20
B972010038 15 35 35 15
B972010039 30 30 20 20
B972010040 20 30 20 30
B972010042 20 30 30 20
B972010043 - - - -
B972010044 35 25 25 15
B972010045 30 30 20 20
2009年2月20日 星期五
本學期報告之二 - 玩一個演化相關的電玩
許多線上遊戲業者近年來也開發出一些與演化模擬相關的遊戲, 主要的有Spore, Avida與Evolve等遊戲. 請同學在這個學期要玩一個遊戲, 並在修習過演化相關的章節後比較這些遊戲的設計與演化生物學的理論有何差異. 遊戲版本或語言介面請同學自行選擇.
未來的人類會是什麼樣子?
[節錄自科學人2月號]
撰文╱華德(Peter Ward)
翻譯/涂可欣
你聽了可能會有點驚訝:人類仍持續在演化,我們的身體和腦與人類祖先不盡相同,我們的後代也將和我們有所差異。
重點提要
●一般認為現代智人在更新世之後就不太演化,然而探討全世界族群基因資訊的新研究發現,人類演化速度在農業和城市發展後反而加快了。
●如果我們持續演化,一千年後,在經歷了環境和社會帶來的意外發展後,人類會是什麼模樣?臆測的答案從充滿希望到惡托邦夢魘都有。
若問起人們對未來人類模樣的想像,獲得的答案通常只有兩種。有些人會提起舊時科幻小說的描述:額頭凸起、智商更高的大腦人;另外一派會說人類身體不會再演化,科技已終結了殘酷的天擇,只剩文化仍在繼續演化。
大腦人的說法並沒有什麼真正的科學根據,分析人類過去幾千代的頭顱化石記錄,可看出人類腦容量的快速增長時期很久以前就結束了,因此幾年前提出上述問題時,大多數科學家都會選擇人類身體的演化已停滯的觀點。但是以DNA技術檢測從前和現今的基因組,卻得到完全不同的結果,掀起了演化學研究的革命。在現代智人誕生後,不僅重大的基因重組事件仍層出不窮,演化速度甚至越來越快。人類和其他生物一樣,在物種形成初期,體型會經歷最劇烈的改變,然而之後在人類的生理(可能還有行為)上,基因仍繼續引發著改變。直到人類史近期,分散在世界各地的人類,差異仍是有增無減,即使到了今日,現代化的生活還是繼續驅動著一些影響行為性狀的基因的演變。
如果巨大的腦不是人類未來的走向,那麼什麼才是?我們的體型會變大或變小?會越來越聰明還是越來越笨?那些新冒出來的疾病和全球升高的氣溫會影響人類的演化嗎?會有新人種出現嗎?或者當我們把矽和鋼裝入我們的腦和身體後,未來人類的演化就不再取決於基因,而是科技?我們會淪為主宰地球未來的下一個智慧體:「機器」的建造者嗎?
頭號演化者
追溯人類演化一直是研究遠古化石的古生物學家的範疇。人科動物的歷史可溯至700多萬年前,那時出現了一小群稱為查德沙赫人(Sahelanthropus tchadensis)的原始人,之後人科陸續加入了許多相當多樣的成員,實際數字仍有爭議,我們已知的至少有九種,而且在殘缺不全的化石記錄裡,肯定還埋藏著其他人科動物的痕跡。由於早期人類遺骸很少能不被動物吃掉而保存在沉積岩中,這個估計數字每年都會隨著發表在論文上的新發現和新詮釋而變動。
每個新物種的演化,都是因為一小群個體與較大族群分隔幾代後,為了適應全新的環境條件而產生改變。在與同類分開久了之後,這個小群體在遺傳路上獨行,最後其成員再也不能與親代族群交配繁殖。…more
【欲閱讀更豐富內容,請參閱科學人2009年第84期2月號】
撰文╱華德(Peter Ward)
翻譯/涂可欣
你聽了可能會有點驚訝:人類仍持續在演化,我們的身體和腦與人類祖先不盡相同,我們的後代也將和我們有所差異。
重點提要
●一般認為現代智人在更新世之後就不太演化,然而探討全世界族群基因資訊的新研究發現,人類演化速度在農業和城市發展後反而加快了。
●如果我們持續演化,一千年後,在經歷了環境和社會帶來的意外發展後,人類會是什麼模樣?臆測的答案從充滿希望到惡托邦夢魘都有。
若問起人們對未來人類模樣的想像,獲得的答案通常只有兩種。有些人會提起舊時科幻小說的描述:額頭凸起、智商更高的大腦人;另外一派會說人類身體不會再演化,科技已終結了殘酷的天擇,只剩文化仍在繼續演化。
大腦人的說法並沒有什麼真正的科學根據,分析人類過去幾千代的頭顱化石記錄,可看出人類腦容量的快速增長時期很久以前就結束了,因此幾年前提出上述問題時,大多數科學家都會選擇人類身體的演化已停滯的觀點。但是以DNA技術檢測從前和現今的基因組,卻得到完全不同的結果,掀起了演化學研究的革命。在現代智人誕生後,不僅重大的基因重組事件仍層出不窮,演化速度甚至越來越快。人類和其他生物一樣,在物種形成初期,體型會經歷最劇烈的改變,然而之後在人類的生理(可能還有行為)上,基因仍繼續引發著改變。直到人類史近期,分散在世界各地的人類,差異仍是有增無減,即使到了今日,現代化的生活還是繼續驅動著一些影響行為性狀的基因的演變。
如果巨大的腦不是人類未來的走向,那麼什麼才是?我們的體型會變大或變小?會越來越聰明還是越來越笨?那些新冒出來的疾病和全球升高的氣溫會影響人類的演化嗎?會有新人種出現嗎?或者當我們把矽和鋼裝入我們的腦和身體後,未來人類的演化就不再取決於基因,而是科技?我們會淪為主宰地球未來的下一個智慧體:「機器」的建造者嗎?
頭號演化者
追溯人類演化一直是研究遠古化石的古生物學家的範疇。人科動物的歷史可溯至700多萬年前,那時出現了一小群稱為查德沙赫人(Sahelanthropus tchadensis)的原始人,之後人科陸續加入了許多相當多樣的成員,實際數字仍有爭議,我們已知的至少有九種,而且在殘缺不全的化石記錄裡,肯定還埋藏著其他人科動物的痕跡。由於早期人類遺骸很少能不被動物吃掉而保存在沉積岩中,這個估計數字每年都會隨著發表在論文上的新發現和新詮釋而變動。
每個新物種的演化,都是因為一小群個體與較大族群分隔幾代後,為了適應全新的環境條件而產生改變。在與同類分開久了之後,這個小群體在遺傳路上獨行,最後其成員再也不能與親代族群交配繁殖。…more
【欲閱讀更豐富內容,請參閱科學人2009年第84期2月號】
2009年2月18日 星期三
有關成績比例的安排
再度提醒各位同學, 本學期的成績比例由同學自訂. 請依據以下項目分配設定各項目的比例, 總分加起來是100分. 請告知女班代各位所希望的比例分配.
- 小考 (指平常的小考)
- 作業 (指課後的作業)
- 報告 (指課堂上的口頭報告以及書面報告)
- 師生互動與討論 (指課堂或課後的討論與發言)
2009年2月17日 星期二
寫e-mail的基本禮節
- 寄件人應顯示姓名, 而非綽號或ID
- 信件應有標題, 標題應是信件的主旨, 而不是什麼"老師~~~", "那個~~~", "我想問~~~", 也就是拿著信件的第一句撒嬌語當成信的標題. 請弄清楚這是信件而不是MSN聊天...
- 信件起頭應該有敬語問候, 並清楚說明自己是誰.
- 儘可能不要使用yahoo寄信, 因為信件中會有不必要的廣告與banner
- 絕對扣分的信件: (1) 標題空白或"如題"; (2) 內容空白或"如題".
2008-02-25上課前準備事宜
- 02/25起上課時間為08:30開始, 11:30前結束.
- 上第一節課可以吃早餐(不宜太香), 垃圾不可丟在教室, 否則就死當了
- 02/25歡樂小測驗不需準備. 測驗的範圍為高中至大一普生課本的"架構", 目的是瞭解同學對於已修習知識內容的連結與融會程度. 測驗於8:30 AM準時開始. 本課程所有測驗皆無補考.
- 重修同學(僅限大二重修者)本學期可決定是否要跟著大一的上課與考試進度修課. 若認為重修一次已經很無聊了, 可與老師面談採用專題報告的方式代替所有考試. 而其專題報告可自選五個先前修課時自認為學得最不好的部份為題材. 若有意願採用此方式修課者, 請於2/20前與老師聯絡.
- 若有臨時突發狀況無法前來上課, 請與本研究室聯絡 07-5252000 ext 3612, 或寫e-mail告知老師.
2009年2月15日 星期日
2009年2月10日 星期二
以實驗證明天擇說
下面文章節錄自《科學人電子雜誌第84期/2009年2月號》 (達爾文200歲 紀念特輯)
以實驗證明天擇說
生物學家使用最精密遺傳工具,發現天擇對基因演化的影響,可能比之前絕大多數演化學家所想的深遠。
撰文╱奧爾(H. Allen Orr);翻譯/陳儀蓁
重點提要
●達爾文的理論,也就是提高生存機會的遺傳特徵受到天擇而推動演化,是經歷許多理論競爭後,才在今日生物學中得到認可。
●沒有正面或負面影響的隨機遺傳突變,曾被視為分子層次改變的主要推手,但是最近的實驗顯示,由天擇所推動的有利遺傳突變,其實並不少見。
●植物遺傳學的研究顯示,單一基因的改變,有時候對物種間的適應差異有很大的影響。
生物學家使用最精密遺傳工具,發現天擇對基因演化的影響,可能比之前絕大多數演化學家所想的深遠。
撰文╱奧爾(H. Allen Orr);翻譯/陳儀蓁
重點提要
●達爾文的理論,也就是提高生存機會的遺傳特徵受到天擇而推動演化,是經歷許多理論競爭後,才在今日生物學中得到認可。
●沒有正面或負面影響的隨機遺傳突變,曾被視為分子層次改變的主要推手,但是最近的實驗顯示,由天擇所推動的有利遺傳突變,其實並不少見。
●植物遺傳學的研究顯示,單一基因的改變,有時候對物種間的適應差異有很大的影響。
有些觀念在科學發展的歷程中較晚才發現,是因為微妙、複雜或是艱難,但是天擇說並非如此。跟其他革命性的科學思想比起來,天擇說的發現是比較晚近的事,達爾文和華萊士在1858年寫下天擇說,達爾文的《物種起源》在1859年才問世,但天擇說的觀念其實相當簡單。在特定的情況下,有些個體適應得比其他個體要好,這些個體產下較多的子代,隨著時間過去而變得比較常見。環境「選擇」這些在現有條件下適應得最好的個體,如果環境條件改變,那些擁有最適合新環境特徵的個體,就會取得優勢。達爾文主義之所以具革命性,並不是因為提出晦澀難解的生物學說,而是指出自然界背後的邏輯其實意外的簡單。
天擇說儘管簡明易懂,仍經歷了漫長且曲折的歷史。達爾文對於物種演化的主張很快就為生物學家接受,但是他的另一個主張,也就是天擇推動大部份的演化,則不然。確實,直到20世紀後期,科學家才接受天擇是主要演化驅力的說法。
天擇說的地位現在十分穩固,而這也反應了過去幾十年來詳細的實證研究。但是天擇的研究絕對還未完成,不過由於新的實驗技術的出現,加上構成天擇的遺傳機制現在是嚴謹的實證研究主題,跟20年前比起來,天擇的研究今天在生物學中更活躍。近來針對天擇的實驗工作,主要集中在三個目標:確定天擇有多普遍,辨識由天擇引發的適應背後的遺傳改變,以及評估天擇在演化生物學的關鍵問題,也就是在物種起源中究竟扮演了多重的角色。
天擇說的地位現在十分穩固,而這也反應了過去幾十年來詳細的實證研究。但是天擇的研究絕對還未完成,不過由於新的實驗技術的出現,加上構成天擇的遺傳機制現在是嚴謹的實證研究主題,跟20年前比起來,天擇的研究今天在生物學中更活躍。近來針對天擇的實驗工作,主要集中在三個目標:確定天擇有多普遍,辨識由天擇引發的適應背後的遺傳改變,以及評估天擇在演化生物學的關鍵問題,也就是在物種起源中究竟扮演了多重的角色。
天擇的基本:變異與篩選
了解天擇推動演化最好的方式,就是考慮生命週期特別短、可以觀察許多世代的生物。有些細菌每半小時就可以繁殖一次,所以想像由兩種基因型組成的細菌菌落,一開始A、B兩種基因型的細菌數目相同。再假設,這兩種細菌都各自繁衍後代,即A型細菌只繁殖A細菌,B細菌只繁殖B型細菌,現在假設環境突然改變了,出現一種抗生素,A型細菌有抵抗能力,但是B型細菌沒有。在新環境中,A型細菌的適應力比B型細菌強,它們能存活下來,繁殖比B型細菌更多的個體。結果就是A型細菌的子代比B型細菌多。
了解天擇推動演化最好的方式,就是考慮生命週期特別短、可以觀察許多世代的生物。有些細菌每半小時就可以繁殖一次,所以想像由兩種基因型組成的細菌菌落,一開始A、B兩種基因型的細菌數目相同。再假設,這兩種細菌都各自繁衍後代,即A型細菌只繁殖A細菌,B細菌只繁殖B型細菌,現在假設環境突然改變了,出現一種抗生素,A型細菌有抵抗能力,但是B型細菌沒有。在新環境中,A型細菌的適應力比B型細菌強,它們能存活下來,繁殖比B型細菌更多的個體。結果就是A型細菌的子代比B型細菌多。
「適應力」(fitness)在演化生物學中是解釋以下概念的術語:在特定環境中存活或繁殖的可能性。天擇在無數事件脈絡中重複作用的結果,呈現於我們今天所見到的大自然中以精巧方式適應各自環境的動物、植物(和細菌)。
演化遺傳學家可以在上面的論述中導出更豐富的生物學細節。舉例來說,我們知道不同的基因型來自DNA的突變,而核酸序列(由字母A、T、C、G串連組成)中的隨機改變,又組成了基因組的「語言」。我們也清楚了解,DNA其中一種字母變成另一種字母這類常見的突變出現的速率,在每一世代、每一配子的每一核酸上發生的機會大約是10億分之一。最重要的是,我們多少了解突變對生物適應力的影響。絕大多數核酸的隨機突變是有害的,也就是說,這些突變降低生物的適應力,只有一小部份是有利的,能夠提高適應力。其他形式的突變大部份也是一樣。就像電腦程式碼中打字錯誤會引發問題,在精密校準的系統中,隨機的改變更有可能干擾正常的運作,而非改善。
適應性演化因此分為兩個步驟,天擇和突變會精準的分工,每一世代,突變都會為族群帶來新的遺傳變異,天擇則負責篩選這些變異。嚴苛的環境會降低族群中「壞的」(相對而言不適應)突變的數目,並提高「好的」(相對而言適應)突變的數目。值得一提的是,一個族群可以同時儲存許多遺傳變異,而這些變異在環境改變時可以協助族群度過。幫助A型細菌抵抗抗生素的基因,也許在一開始沒有抗生素的環境中一無是處或甚至稍微有害,但是這個基因的存在讓A型細菌面臨環境改變時得以存活。
族群遺傳學家也以數學的方式描述天擇,並且提出看法。例如遺傳學家指出,一個基因型在族群中的適應力越強,所佔比率增加得也越快。的確,我們可以計算出這類比率增加的速度。族群遺傳學家也發現一件驚人的事實,即天擇有超乎尋常的銳利「眼睛」,可以看出不同基因型適應力間極微小的差異。就算在有百萬個體的族群中,天擇也可以揪出那百萬分之一的不同。
天擇說一項值得注意的特性,在於它似乎在生物實體任一層次(基因到物種)都有效。自達爾文以降的生物學家,當然仔細推敲過個體間的適應差異,但是原則上天擇可以解釋任何單位之間的生存或繁殖差異。譬如說,你可能推論地理分佈範圍廣闊的物種(以物種為單位)存活的時間,比地理分佈範圍狹隘的物種要久。畢竟,分佈範圍廣的物種可以容忍幾個地方族群的滅絕,局限在某些地區的物種就不能。順著天擇說的邏輯,隨著時間推展,分佈範圍廣的物種數目應該會增加。
雖然這項論述聽起來十分合理,而且演化學家的確懷疑更高層次的選擇會不時發生(見第46頁〈群體有什麼好處?〉),大多數的生物學家仍同意天擇通常發生在個體或基因的層次,原因之一是個體的壽命比物種的壽命短,因此天擇對個體的篩選往往蓋過對物種的篩選。
向達爾文致敬
下面文章節錄自《科學人電子雜誌第84期/2009年2月號》 (達爾文200歲 紀念特輯)
向達爾文致敬
維多利亞時代,一個學院外的人花了一輩子蒐集觀察資訊,不厭其煩地思考自然界的運作方式。他在150年前提出的理論,依舊是驅動科學研究的典範。
撰文╱斯蒂克斯(Gary Stix);翻譯∕王道還
撰文╱斯蒂克斯(Gary Stix);翻譯∕王道還
重點提要
●達爾文(Charles Darwin, 1809~1882)發表的《物種原始論》(或譯為《物種起源》),已歷經了150年的考驗。
●但是,他對於演化的睿見與遺傳學融合之後,演化理論擴張了,也改變了。
●演化生物學仍然必須設法解決當年困擾達爾文的同樣問題。例如,什麼是「物種」?
●達爾文(Charles Darwin, 1809~1882)發表的《物種原始論》(或譯為《物種起源》),已歷經了150年的考驗。
●但是,他對於演化的睿見與遺傳學融合之後,演化理論擴張了,也改變了。
●演化生物學仍然必須設法解決當年困擾達爾文的同樣問題。例如,什麼是「物種」?
1835年9月,英國海軍的小獵犬號駛入了加拉巴哥群島。達爾文是船上的一員,當時26歲。他並沒注意到當地現稱為「達爾文雀」的那一群鳥,事實上,他將當中幾種錯認為厚喙鳥,虧他還是個自然學者。達爾文回到英倫後,鳥類學者兼畫家古爾德(John Gould)為小獵犬號帶回的鳥兒標本繪製圖畫,結果古爾德發現,那些鳥全是雀鳥(finche)的不同物種。
達爾文是自學出身的自然學者,古爾德的研究結論使他了解,加拉巴哥群島上的雀鳥,喙嘴為了遷就食物的大小,如種子或昆蟲,許多世代後必然發生了變化。他在1839年出版的《小獵犬號航海記》中寫道:「從這一小群關係密切的鳥兒中,發現一個構造有漸次歧異的現象,難免會教人想像,在這些海島上一開始只有一小群鳥,都是同一個物種,然後分別朝不同的目標逐漸變化。」
20年後,達爾文將雀鳥因適應不同島上的生存條件而變化這一睿見,發展成完整的生物演化理論。這理論的重點是,「自然選擇」(天擇)會確保有利於生存的性狀遺傳給未來的世代。達爾文理論的核心,歷經科學與宗教的批評,仍然是各種研究問題的起點;那些問題五花八門、無窮無盡,繼續啟發現代科學家的研究。生物學者仍在尋找實驗證據,勾勒天擇在分子層次上的運作模式,以及那個模式影響新物種形成的方式。
對達爾文雀的研究,還在提供答案。過去科學家假定演化是個緩慢的過程,人類壽命短暫,不會覺察因演化而發生的變化。哪裡知道,達爾文雀居然成為研究實時演化的理想對象,因為牠們繁殖得相當快,又彼此隔離在不同島上,很少遷徙。
1970年代起,美國普林斯頓大學的演化生物學家葛蘭特夫婦(Peter&Rosemary Grant)就把加拉巴哥群島當做一個巨大的實驗室。他們在那裡觀察的達爾文雀超過兩萬隻,結果證明「聖嬰」出現之後,氣候從濕轉乾,新世代鳥兒喙嘴與身體的平均尺寸都變了。他們也記錄了一些案例,可能是正在萌發階段的新物種。
不只葛蘭特夫婦,許多團隊都踏上了目擊演化之路。達爾文認為演化是緩慢而穩定的過程,但有時演化會以爆發性的速率發生,以年為測量單位,而非模糊的「億萬年」,否定了他的信念。非洲大裂谷大湖中的慈鯛魚、阿拉斯加的棘魚、中南美洲與加勒比地區無蹼的卵齒蟾(Eleutherodactylus),都是有名的例子。
演化思想源遠流長,甚至在蘇格拉底之前就出現了,不過古人感興趣的往往只是「適者」如何勝出。18、19世紀的學者對於生物如何演化,提出了許多想法,達爾文的祖父也提出過。
達爾文的演化論無論在19世紀還是在後來,都是第一個經得起嚴格科學檢驗的理論。現今的研究者擁有精密攝影機、電腦與DNA檢驗工具等當年小獵犬號絕不可能配備的儀器,證明了達爾文的想法仍然活力充沛。達爾文這位自然學者的理論,對基礎科學與應用技術(從生物科技到鑑識科學)仍有實用價值,難怪今年全世界都在紀念達爾文200歲冥誕,以及他的傑作《物種原始論》出版150週年。
達爾文的理論是現代科學的支柱之一,地位與相對論、量子力學及其他重要的基礎理論相當。正如哥白尼將地球逐出宇宙中心,在達爾文的宇宙中,人也不是自然界的中心。天擇可以解釋美國加州大學爾灣分校演化生物學者艾亞拉(Francisco J. Ayala)所謂的「沒有設計者的設計」,他用這個說法化解了某些神學家詆毀演化論的凌厲攻勢。2007年,艾亞拉寫道:「達爾文完成了哥白尼革命,為生物學建立了一個新概念——自然是運動中的物質組成的系統,受法則的支配,人類理性毋須訴諸超自然媒介即可解釋。」
在這個值得紀念的年份裡,我們在龐大的研究與理論文獻中都能找到達爾文最偉大的遺產。那些研究是直接從他的著作演繹出來的,也展現了演化論這150年來的根本變化——達爾文理論與基因科學的匯流。當年達爾文對遺傳學的理解,與古人沒什麼兩樣。
達爾文是自學出身的自然學者,古爾德的研究結論使他了解,加拉巴哥群島上的雀鳥,喙嘴為了遷就食物的大小,如種子或昆蟲,許多世代後必然發生了變化。他在1839年出版的《小獵犬號航海記》中寫道:「從這一小群關係密切的鳥兒中,發現一個構造有漸次歧異的現象,難免會教人想像,在這些海島上一開始只有一小群鳥,都是同一個物種,然後分別朝不同的目標逐漸變化。」
20年後,達爾文將雀鳥因適應不同島上的生存條件而變化這一睿見,發展成完整的生物演化理論。這理論的重點是,「自然選擇」(天擇)會確保有利於生存的性狀遺傳給未來的世代。達爾文理論的核心,歷經科學與宗教的批評,仍然是各種研究問題的起點;那些問題五花八門、無窮無盡,繼續啟發現代科學家的研究。生物學者仍在尋找實驗證據,勾勒天擇在分子層次上的運作模式,以及那個模式影響新物種形成的方式。
對達爾文雀的研究,還在提供答案。過去科學家假定演化是個緩慢的過程,人類壽命短暫,不會覺察因演化而發生的變化。哪裡知道,達爾文雀居然成為研究實時演化的理想對象,因為牠們繁殖得相當快,又彼此隔離在不同島上,很少遷徙。
1970年代起,美國普林斯頓大學的演化生物學家葛蘭特夫婦(Peter&Rosemary Grant)就把加拉巴哥群島當做一個巨大的實驗室。他們在那裡觀察的達爾文雀超過兩萬隻,結果證明「聖嬰」出現之後,氣候從濕轉乾,新世代鳥兒喙嘴與身體的平均尺寸都變了。他們也記錄了一些案例,可能是正在萌發階段的新物種。
不只葛蘭特夫婦,許多團隊都踏上了目擊演化之路。達爾文認為演化是緩慢而穩定的過程,但有時演化會以爆發性的速率發生,以年為測量單位,而非模糊的「億萬年」,否定了他的信念。非洲大裂谷大湖中的慈鯛魚、阿拉斯加的棘魚、中南美洲與加勒比地區無蹼的卵齒蟾(Eleutherodactylus),都是有名的例子。
演化思想源遠流長,甚至在蘇格拉底之前就出現了,不過古人感興趣的往往只是「適者」如何勝出。18、19世紀的學者對於生物如何演化,提出了許多想法,達爾文的祖父也提出過。
達爾文的演化論無論在19世紀還是在後來,都是第一個經得起嚴格科學檢驗的理論。現今的研究者擁有精密攝影機、電腦與DNA檢驗工具等當年小獵犬號絕不可能配備的儀器,證明了達爾文的想法仍然活力充沛。達爾文這位自然學者的理論,對基礎科學與應用技術(從生物科技到鑑識科學)仍有實用價值,難怪今年全世界都在紀念達爾文200歲冥誕,以及他的傑作《物種原始論》出版150週年。
達爾文的理論是現代科學的支柱之一,地位與相對論、量子力學及其他重要的基礎理論相當。正如哥白尼將地球逐出宇宙中心,在達爾文的宇宙中,人也不是自然界的中心。天擇可以解釋美國加州大學爾灣分校演化生物學者艾亞拉(Francisco J. Ayala)所謂的「沒有設計者的設計」,他用這個說法化解了某些神學家詆毀演化論的凌厲攻勢。2007年,艾亞拉寫道:「達爾文完成了哥白尼革命,為生物學建立了一個新概念——自然是運動中的物質組成的系統,受法則的支配,人類理性毋須訴諸超自然媒介即可解釋。」
在這個值得紀念的年份裡,我們在龐大的研究與理論文獻中都能找到達爾文最偉大的遺產。那些研究是直接從他的著作演繹出來的,也展現了演化論這150年來的根本變化——達爾文理論與基因科學的匯流。當年達爾文對遺傳學的理解,與古人沒什麼兩樣。
2009年2月3日 星期二
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