[公告]普生成績計算方式修正

忘了把口頭報告算進去, 修正如下:

小考(四次)(35%), 書面報告(三次)(35%), 口頭報告(20%), 課程參與(10%)三大部份, 計分方式如下:

小考成績內四次小考所佔比例為: 10%, 30%, 30%, 30% (體諒第一次鳥掉的同學)
三次報告佔報告成績比例分別為: 20%, 40%, 40%
課程參與: 指問問題以及上下課與老師的溝通

另外還有特別加分部份 (如參與競試獲得好成績)

[公告]本學期最後一次小考提示

最後一次小考走輕鬆開心路線, 不用再去查那些見鬼又看不懂的資料, 也不需要寫半天以後拿零分, 最後一次小考咱們就考選擇題吧, 只有20題, 單選, 英文出題, 範圍是56-58章, 真開心. 時間是6/11日早上8:30, 只考30分鐘, 由於當天還有2組要報告以及老師的總結, 請勿遲到. 考試時間不會延長, 考完以後立刻改成績.

[說說]當人或不當人

修課不過被當本來就是一件再也簡單不過的學習操作, 如果是必修課, 意思就是再修一次或修到過為止, 然而大多數老師的經驗是: 有不少的重修生根本已經不適合繼續留在這個系, 但不願休學也不願依自己真正的興趣重考, 成績卻也沒有好到可以轉到它系, 造成他不快樂, 然後也成為系上教學上的負擔. 這樣的學生通常不會因為重修而改變自己求學的態度與方法, 他的心態反正就是堵堵看, 或拼拼看, 不過就算了, 反正老子就是跟你耗著. 這種技倆有時候有效, 有些老師因為不再想看到這些擺爛的學生因此就乾脆讓他過了, 但是這樣對其它努力認真但仍然低空飛過的學生來說情何以堪呢?

某些學生(或老師)把當人與不當人當成一種權利操作, 學生總認為當不當人是操之在老師, 或把修一門課當成是電玩卡關, 過了就是過了, 就運氣運氣, 沒過就覺得自己倒楣, 反正被當都是因為老師要當我, 都不是因為自己不努力. 或者, 老子就是承認自己程度差不努力, 但說完以後也不願意做任何的改變. 然後家長也會覺得奇怪, 我的小孩國高中都很乖啊, 為什麼上了大學成績不好呢? 一定是同學帶壞了, 一定是社會太複雜, 一定是老師要求太高, 一定是適應不良, 一定是學校沒有關心我的小孩, 反正千錯萬錯都是別人的錯, 他家的小孩就是全世界最乖的北鼻.

所以大一普生應該要當多少人呢? 應該有固定比例嗎? 當個10-15人應該會讓接下來的普生教學變成負擔吧? 因為人數增多了, 老師沒有時間與力氣花在親自改報告上頭, 所以就採用最簡便的選擇題來考試, 最後的結果就是皆大歡喜, 學生依舊回到國高中的考試應付路線, 老師其實也樂得輕鬆, 反正程度不好就用懶人教法就好了. 我很懷疑這是我們想要的教育.

囉唆半天重點是, 照目前的態勢來看, 我相信某些大一(與重休生)就算被當了應該也不會覺得很難過, 聳聳肩, 出去唱唱歌, 明天依舊充滿打混的機會. 反正同學的關心都會如潮水般貼在留言版上, 回留言都回不完了, 怎麼會有時間傷心自責呢? 大一都已經是20幾歲的人了, 但是還是會不斷地裝可愛或裝不懂, 雖然這段時間流行傻妞和癡漢, 但終究是會退流行的. 請各位想想自己要什麼樣的人生, 糊里糊塗裝瘋賣傻其實一樣可以混口飯吃, 不喜歡待在這個系就應該努力讓自己可以轉系到真正的興趣, 別繼續待在這邊誤了自己的人生.

[公告]最後一次普生報告提示(6/6交)

最後一次的普生報告範圍包含行為生態, 群聚生態, 族群生態, 生態系, 種間交互作用以及生態保育, 請根據你在課本上學到, 於電子或平面媒體報導中尋找與這些議題其中之一相關的媒體報導進行媒體評論. 評論方式如下:

• 首先說明該事件的始末(如油污事件, 國科會開什麼研究成果記者會, 或某學校教授的研究成果上了報)與您挑選該報導的原因
  
• 儘可能收集該事件不同版本的報導來源與文字(包含產官學界的評論, 但鄉民意見不算), 並儘可能比對那些報導來源是第一手報導, 那一些是二手引用
• 對整個事件的始末, 也就是事件的發生, 過程, 後續的發展根據媒體的文字進行整理
• 由於台灣媒體腦殘居多, 因此請就您的科學訓練與知識對這些媒體文字提出科學性的建言與批判, 但若該報導寫得不錯, 也請指出為什麼不錯. 若您發現媒體文字有誤導, 誇大, 不實之處, 請引用科學論文(中英文皆可)加以建議修正
  
• 請勿寫一些垃圾評論, 例如什麼: 我覺得它寫得不錯, 字字珠璣, 蠻好的, 他太主觀了, 但我也說不上來, 老師就別刁難我了
• 篇幅不用多, 不含原始報導的剪輯與圖表, 至多3頁.
  
• 繳交時間為6/6晚間12點整前
  

[公告]普生第三次小考成績

缺考與零分的很多, 零分主因都是因為一整個搞不清楚題意, 有些同學很認真地找資料, 但答題時辭不達意, 或未作答完成, 故得分不盡理想, 請再接再勵

學號	分數	評語
B962010003	85	答題有進步
B962010002	65	答題結構完整但資料方向沒寫到重點, 血液不屬body plan, 說明應多擺在體軸生成上 (差點零分)
B962010001	85	答題有進步
B962010004	95	答題完整
B962010005	0	缺考
B962010006	0	資料方向不正確, 都已經說是要和body plan有關了, 怎麼還執意去找臨床醫學的東西? 況且CCF雖是疾病, 但CCF的生成與limb differentiation無關
B962010007	75	有關”體位是什麼”有些含混不清, 聽起來劍魚像是環節動物似的
B962010010	95	答題完整
B962010008	50	毛髮形成與body plan無關, 但答題結構尚可
B962010012	80	答題有進步
B962010011	85	資料方向正確, 但假說的陳述不夠清楚
B942010003	0	資料方向錯誤, Prx1與Prx2兩個基因只與牙齒是否正常生長有關, 但並非不同功能齒的分化相關基因
B962010044	85	答題有進步
B962010043	0	繳白卷
B962010042	80	資料方向正確, 但研究背景與假說的陳述可再加強
B962010041	100	資料搜尋充份, 答題完整有條理
B962010039	75	研究背景說明不清楚
B962010038	0	資料查找方向不正確, 精細胞發育與body plan無關
B962010037	80	只比較了兩個假說說, 但是對於兩個假說在tatrapoda特徵演化推測的差異完全未提
B962010035	85	答題有進步
B962010034	70	鳥類換毛和脫皮有什麼關係? 每一個觀點都要有三篇論文引述, 但整個作答只引用了三篇
B962010033	85	答題有進步
B962010032	0	資料查找方向不正確, 精細胞發育與body plan無關
B962010031	75	資料查找方向不甚正確(扯到體色, 而非體制), 但問題回答結構不錯
B962010029	65	引用格式錯誤, 研究背景說明還可以再清晰一些, 答題整體來說有進步, 但字實在是太醜
B962010028	0	雖然所引用的資料之研究背景與內胚層腸道相關腺體分化有關, 但整個研究與body plan完全無關
B962010026	60	資料方向正確, 但是對實驗設計幾乎沒有說明
B962010025	0	資料查找方向不正確, 體制和阿拉伯芥種子儲油能力有什麼關係?
B962010024	90	準備充份, 但對研究背景的說明可以再加強
B962010023	95	答題完整, 資料正確
B962010022	70	對研究背景與實驗設計的說明太簡略了
B962010021	0	資料方向錯誤
B962010020	75	引用格式錯誤, 連年代都沒有, 雖然看起來有整理過, 但答題直接抄文章上面的句子感覺上是在撿現成, 整體答題結構有進步
B962010019	0	資料查找方向不正確, 答題草率
B962010018	75	資料方向正確, 但答題結構可再加強
B962010016	50	實驗設計說明潦草, 而且整個研究的重點應該是該基因對zebrafish的body axis的調控使其embryo免於死亡, 但說明的重點完全偏離body的範圍
B962010015	0	資料方向錯誤
B962010014	0	資料方向錯誤
B962010045	70	資料正確, 然對研究背景的說明嫌簡略
B962010013	0	答題結構不錯, 但資料方向完全不對, retina發育與body plan無關
B962010030	0	感覺沒有讀懂platyfish這篇大家超愛的論文摘要. 研究背景說明似乎與該研究沒有直接相關, 然後明明引用的是劍魚的文章, 怎麼都在談子宮著床啊?
B962010036	90	與劉嘉倫引用資料相同, 但答題方向有抓對重點, 對於實驗設計與假說的陳述相當完整
B942010049	95	答題完整, 資料正確
B942010001	70	資料收集完整但未完成作答
B942010038	60	說明了兩個假說, 但是並未比較兩個假說, 也未說明不同假說對四足類特徵演化解釋的差異
B942010037	75	資料正確, 但是對研究方法的實驗設計說明嫌草率
B942010034	90	資料正確, 答題完整
B942010028	75	答題結構佳, 但未作答完成
B942010023	85	答題結構佳, 資料正確
B945020022	95	資料收集完整

[公告]小考作答方式的提示

為了讓各位小朋友不要寫一些讓老師眼睛瞎掉腦漿流出來的東西, 在此建議各位同學作答的格式如下:

• 姓名: 金隨曉
  
• 題目: (老師會在考卷上打好)
• 科學引用來源: (以下是建議格式, 中文在前, 英文在後, 各自依年代排列)

Zhuang, R. 2008. Why is our biology course so nasty? Nature 78: 7788-7878. (期刊論文格式)
姓在前, 名縮寫, 期刊需列出卷期和頁數
邱X全. 2008. 我先去上個廁所. 白目出版社, 高雄. (書籍格式)
洪制X. 2008. 第一章 - 好啦好啦. X定工(編輯), 普生要怎麼樣才會過. 白目出版社, 高雄 (書中的一個章節)
Clack, J.A. 1997. Definition of Tetrapoda. Tree of Life Web Project. URL: http://tolweb.org/notes/?note_id=501. Visited on May 20, 2008. (具有明確作者的網頁資訊, 請勿引用Wikipedia)

• 答題內文: (請有條理地作答)
  
• 相關附圖: (若有必要繪圖說明, 請對所繪的圖編號, 格式為圖1, 圖2, 若圖內有小圖, 則其格式為圖1-A, 圖2-A, 並請在答題內文中標示該段文字與那些繪圖有關)
  

[仙女下凡來解答]第一題看沒有

[許小妹來信]

老師上次寫信問你第一題題目的意思，你說要比較任兩種tetrapoda(四足類動物) 之 sistergroup的假說中對於一些重要特徵的演化趨勢與解讀方向上的差異..另外在blog上回應的是比較四足類起源的"不同假說的差異，以及不同的假說對於某些特徵演化解讀的影響...這兩個題目表示的意思好像不太一樣，所以我不知道要往哪個方向找資料，可以請你再說一次嗎?

[解說]

• 首先要弄清楚什麼是tetrapoda (英文是tetrapod), 因為新化石不斷地出現, 因此對於tetrapoda這個名詞可以涵擴的生物類群就會有所不同, 若有新的物種被置入tetrapoda, 那麼就有可能改變原本科學家對於tetrapoda所共同具有的特徵(synapomorphy)以及特徵演化的看法, 舉例來說, 去認為人科動物的現生物種只有現代智人, 但當人科的定義延伸擴及黑猩猩的時後, 人科的synapomorphy就會有所調整. 過去有些被認為是人類獨有的特徵(autapomorphy)可能在黑猩猩也被發現, 因此那些特徵就會從人的autapomorphy成為人+黑猩猩的synapormophy. 也就是說, 要先釐清所謂的tetrapoda在不同的演化假說下是否有著不同的涵蓋範圍? 而不同的涵蓋範圍是否意味著不同的假說下, 支持tetrapoda為一個單系群(monophyletic group)的特徵是不同的?
  
• 當你找到某個假說明確告訴你, 什麼是tetrapoda之後, 你便開始觀察這個假說認為tetrapoda的姐妹群是何者? hypothesis 1倡議Y是(A+(B+(C+D)))的姐妹群, 而hypothesis 2認為X才是(A+(B+(C+D)))的姐妹群. 因為假說不同, 因此支持Y與ABCD, 或X與ABCD的特徵分布就會不同. 以hypothesis 1來說, 黃色特徵成為Y與ABCD的synapormophy (也就是說這個特徵在演化史上只起源一次), 但在hypothesis 2中, 黃色特徵在Y與ABCD就變成趨同演化(convergent evolution)了.
• 我們只討論tetrapoda的起源(也就是tetrapoda的姐妹群是誰)的不同假說, 在特徵演化推測方面的差異, 尤其是與進入陸地之前的前適應(pre-adaptation)有關的特徵 (如視覺色素, 前後肢骨隔, 呼吸系統, 血球, 等等等)演化趨勢, 都應該可能隨著假說不同而改變
• 作答的重點是: 提出兩個假說的文獻來源, 假說的異同 (記得要把樹簡單畫出), 若你已設定要討論某一些特徵的演化趨勢, 那麼就要把這些特徵是否在某假說下是趨同演化, 或是同源演化(也就是單次起源)標識清楚
• 另外, 有些假說的內群(如ABCD)內部關係可能有所差異 (如下圖), 但內群的內容(都是ABCD)是一樣的, 這就不是我們要尋找的重點, 因為我們要討論的是tetrapoda的起源, 而不是tetrapoda內部的關係 (如鳥接近鱗龍類, 或鱷類)

[公告]普生成績的計算方式

普生成績分為

小考(四次)(45%), 報告(三次)(45%), 課程參與(10%)三大部份, 計分方式如下:

小考成績內四次小考所佔比例為: 10%, 30%, 30%, 30% (體諒第一次鳥掉的同學)
三次報告佔報告成績比例分別為: 20%, 40%, 40%
課程參與: 指問問題以及上下課與老師的溝通

另外還有特別加分部份

各位可以算算目前已經得幾分了

[仙女下凡來解答]第一題是怎樣啊

[吳小弟的來信]: 老師請問一下, 根據附件的圖, 課本說Amphiba是最早的四足類，所以我們所要探討的姊妹群指的是Dipnoi(lungfish)嗎?
[答]: 不是, 我們的問題是比較四足類起源的"不同假說". 四足類的起源假說並不只有課本上的這個, 因次請各位同學查查還有什麼其它有別於這個假說, 並比較兩個假說的差異, 以及不同的假說對於某些特徵演化解讀的影響

[仙女下凡來解答]什麼是姐妹群啊

老師,

Q1. 姐妹群的意思是指那些由同一個ancestor演化出來的taxa?

Fig 1:

Q2. 是不是演化樹上每個branch的交點都代表有一個ancestor?
Q3. 這些演化樹是在描述物種之間的親綠關係? 如果是，那Cichlid是跟Frog還是Lamprey的親綠關係比較接近?
Q4. Lamprey的姐妹群是 (Cichild + Frog + Turtle + Kangaroo + Mouse + Human)? 但Human的姐妹群只有Mouse嗎?..=-=!...

Fig 2:

Q5. 在演化樹上, B演化成taxon 1和C. 那有可能只是某些B演化C, taxon 1是沒有演化的B?
Q6. ingrop 和outgroup是怎麼定義? 要有甚麼條件, 才可以把一些taxa歸類為同一group?

解答:

1. 不, 姐妹群是指衍生自最近共祖(common ancestor)的兩個分類群, 以Fig.1來說Human是Mouse的姐妹群, Human+Mouse是Kangaroo的姐妹群, ((Human+Mouse)+Kangaroo)是Turtle的姐妹群, 這樣有瞭嗎?
2. 不, 應該是每一個branch代表的才是一個共組系 (common ancestry)
3. 不, 和Cichlid最近的是(Frog + (Turtle + (Kangaroo + (Human + Mouse))))
4. 是的
5. 有可能的, 之前上課說過的, 如果對於物種觀(species concept)中物種定義的解讀是如此圖所示的(a), 那麼表示在這樣的概念下, Taxon 1是由B種演化來的新種, 而B種會繼續存在(而不會就變成C種).
   
6. Ougroup與ingroup是操作親緣關係分析(phylogenetic analysis)使用的術語. 我們打算分析其親緣關係的類群即是內群(例如我們想要分析所有品種的狗是否是單一馴化, 或是分別在各大陸由不同民族所馴化, 那麼所有品種的狗就是內群). 外群outgroup在理論上是與ingroup關係最近的姐妹群. 因此就狗的這個命題來說, 外群的選擇就應該是各種狼. 設置外群的目的是要置根(rooting), 以決定特徵演化的方向, 如果分析結果顯示內群是一個單系群(也就是所有的狗的品種並未與狼混在一起), 那麼就比較可能佐證所謂的狗是人類歷史上一次馴化產生的產物. 如果分析結果顯示狗與狼的關係混在一起, 那麼這樣的結果便說明所謂的狗其實是各地的狼在不同的時間被不同的民族所馴化出來的產物. 然而在真實世界中, 我們常常不知道我們有興趣的生物類群(ingroup)的最近緣姐妹群是誰(如龜), 因此在分析上會使用大量的外群提高找到最近外群的可能性.
   

[公告]生物競試的題型

通通是單選題, 英文出題, 請各位要參加的同學拼了, 請留意考試時間地點以及系上的海報通知

[公告]第三次小考題目

時間: 5/21早上8:30
題目: (三擇一)

1. 請比較有關四足類動物(tetrapoda)的起源與其姐妹群的任兩種假說. 請說明其提出年代, 作者, 文獻來源, 假說異同, 以及不同的假說對於四足類形態與生理(如呼吸, 循環, 視覺, 聽覺, 生殖等等)演化趨勢推測的差別.
2. 請說明: (1) 頭部專化(cephalization), (2) 兩側對稱(symmatry), (3) 具有羊膜, 以及(4) 蛻皮(moulting or ecdysis)在具有這些特質的後生動物(metazoa)演化上的意義. 對於每一個演化事件意義的說明請至少引用三篇科學論文的觀點佐證.
3. 請引用一個非課本上例子的實驗說明Homeobox genes在調控生物體制發育上的重要性. 請簡述該研究的假說與欲回答的問題, 實驗設計, 與結果.

作答前請打草稿, 規劃一下應如何完整地回答一個問題. 不要拿一堆網路上印來的東西沒腦地亂抄, 照抄網路上的答案一律零分計, 若發現有兩人抄一模一樣的網路資料兩人皆視為零分計算.

[公告]有關生物競試的準備方向

其實一整個就是沒方向, 沒方向的意思就是什麼都要唸啦, 但有一些部份尚未教到 (如環境科學, 生態系, 物種交互關係), 因此那些部份的出題應該會減少. 然而生物競試的題目是中山與成大一起出題的, 因此欲參加競試的同學仍然必須要融會貫通. 成大使用的課本是Campbell第八版, 如果想要跟成大拼了, 然後又想要獲得亞洲來回機票的同學, 可以試著看看Campbell的內容. 老師這邊有一本與其解題光碟, 歡迎同學借回去看.

[公告]九十六學年度中山-成大校際基礎學科生物科競試

• 考試時間：九十七年五月三十一日（星期六）上午9:00~10:40
• 考試地點：國立中山大學理學院(理1003教室)
• 考試範圍： 1.細胞 2.遺傳 3.演化機制 4.植物的形態與功能 5.動物的形態與功能
• 命題方式(選擇題100題，英文命題) ※請自行準備2B鉛筆
• 獎勵

1. 傑出獎：成績在前1%者，頒給中英文獎狀一紙獎金新台幣3000元。
2. 特優獎：成績在前3%者，頒給中英文獎狀一紙獎金新台幣2000元。
3. 優等獎：成績在前5%者，頒給中英文獎狀一紙獎金新台幣1000元。
4. 甲等獎：成績在前10%者，頒給中英文獎狀一紙獎金新台幣500元。

老師加碼:

• 參加並獲傑出獎者加總成績8分(若超過100以99分計), 其中成績最高且, 有意願且時間可配合者贈亞洲來回機票一張 (可能參訪地點: 北海道或泰國拷秋保護區)
  
• 參加並獲特優獎者加總成績6分
• 參加並獲優等獎者加總成績4分
• 參加並獲甲等獎者加總成績2分
• 參加且成績在前20%者加總成績1分
  

[參考]saa的普生報告二

http://www.bio.nsysu.edu.tw/Temp/

資料收集很完整, 而且編排與內容的豐富度很好, 請各位參考

[說明]什麼叫作命名史

作業二中所謂的命名史(nomenclatural history)是指一個物種的種級學名的變遷歷史, 什麼叫命名的變遷歷史? 一個物種最初被命名的時候會有一個原始的學名組合, 也就是屬名(generic name)加上種小名(specific name), 但是生物的分類時有變革, 該物種很可能會轉移至其它的屬, 因此屬名就可能會更換. 有些時後不同的生物學者會在不同的時間對同一種生物命名, 為了保持生物命名的一致, 國際上有數個生物命名規約在特定的條款下將選擇其中一個學名作為該生物的有效學名. 而其它就成為其同物異名(synonym). 以EOL中的Microctenopoma ansorgii這種攀鱸的例子來說明:

點選Catalogue of life synonyms會出現如下的表列
Anabas ansorgii Boulenger, 1912 synonym
Anabas davidae Poll, 1939 synonym
Ctenopoma ansorgei (Boulenger, 1912) synonym
Ctenopoma ansorgii (Boulenger, 1912) synonym
Ctenopoma davidae (Poll, 1939) synonym
Microctenopoma ansorgei (Boulenger, 1912) synonym

這條魚的現用有效學名就如該網頁標題所示, 是Microctenopoma ansorgii (Boulenger, 1912), 那麼這一卡車學名是什麼? Anabas ansorgii Boulenger, 1912顯然是Microctenopoma ansorgii的原始組合, 然後在Anabas與Microctenopoma之間, 還有其它的學者把ansorgii歸屬於Ctenopoma屬, 因此出現了Ctenopoma ansorgii這樣的組合. 而Poll在1939年所命名的davidae顯然是ansorgii的同物異名, 但因Poll發表較晚, 因此davidae就成為其次同物異名 (juniosr subjective synonym). 講了半天, 同學應該如何去找到這些異名呢? 請先試試Catalogue of Life的搜尋, 例如查找大鳳蝶 (Papilio memnon), 就會出現一卡車的同物異名, 以及其有效學名. 請各位再依EOL格式編寫即可.

[拍血]三太子顯靈神蹟重新上傳

在這兒: Link: http://download.yousendit.com/A439CF115318198C

[暖流]三太子下凡與兩仙女拼場

數小時前接獲512來信, 說-->這, 拿去服用吧, 裏面還有服用說明呢, 然後他就飄走了. 512所提供的藥方是可直接開啟並編輯的html檔案, 所以各位弟弟妹妹們, 現在有了靜態圖檔讓你們直接貼文字, 也有線上網頁與離線網頁讓各位編輯, 這種事情幾百年來不會再發生了. 加油吧.

[公告]5/14日報告同學請準備預講

請報告同學於5/12-13與老師預約時間進行預講

[溫馨]兩仙女秘製普生報告二版型普渡眾生

自普生報告二開催以來, 修習普生之同學皆因有苦說不出有痛不能訴導致滿臉大便與豆花, 且經常於宿舍地上打滾或螢幕前口吐白沫, 甚至在浴室裏唱國歌或跳國標舞. 大一全班面臨崩潰邊緣. 然所謂重賞之下必有勇婦, 近日出現兩名仙女各自調製兩種款式之普生報告二版型, 並免費奉送予各位童男童女服用. saa仙女調製之秘方稱為"掰唷生物大魔王", 配方是PHP與html組成. lec仙女調製的產品稱為"模版決定版", 僅有七天的效期, 由photoshop所製造, 以任何繪圖軟體或powerpoint吞服即可. 服用若有身體不適的現象請找兩位仙女算帳或報告老師.